La quatrième saison de Bungou Stray Dogs. Ne s'intéressant plus aux affaires militaires, Yukichi Fukuzawa a l'intention d'agir en tant que garde du corps indépendant, mettant à profit ses talents mortels à l'épée. Cependant, les choses ne se passent pas comme prévu pour son activité indépendante, et c'est alors qu'il croise le chemin d'un garçon bavard nommé Ranpo Edogawa. Si leurs premières interactions sont liées à une étrange affaire de meurtre, les conséquences de celle-ci mènent à la création de l'Agence de détectives armés. Ranpo se retrouve alors à la poursuite d'un individu doué d'une dangereuse capacité à commettre le crime parfait. Mais alors que le grand détective élucide l'affaire, il découvre bientôt un complot élaboré visant à anéantir l'Agence dans son ensemble. Bien que prévenue du piège, l'Agence poursuit sa traque des criminels, pour finir par être elle-même accusée du crime. Désormais considérés comme des terroristes recherchés, les membres restants doivent trouver un moyen de prouver leur innocence, même s'ils doivent pour cela demander l'aide de leurs ennemis jurés.