L'Aquarion, une combinaison de combat mécanique géante, est la meilleure arme de l'humanité contre les menaces interstellaires. Pendant des milliers d'années, les pilotes humains se sont entraînés et ont travaillé ensemble pour vaincre les Anges de l'ombre, les ravisseurs envahissants et les monstres à énergie cinétique. Une fois de plus, l'humanité doit se tourner vers l'Aquarion. Le sort de la Terre étant en jeu, la combinaison suffira-t-elle à sauver l'humanité ?